Homework_2020Bioinformatics

Structure Motif

Posted by Yajin on December 3, 2020

YajinMo_Homework_2020/12/03

Structure Motif

motif结构预测结果一般使用weblogo或者其他logo软件可视化:

  1. 横坐标代表序列位置;

  2. 纵坐标分为probability和bits两种,前者表示各个位点不同核苷酸/氨基酸所占概率,后者表示信息熵,计算公式为H = -∑(Pilog2(Pi)),数值越大表示信息混乱程度越高,序列不保守。